Πρωταρχικό μέλημα του «Ιδρύματος Μαριάννα Β. Βαρδινογιάννη» είναι η παροχή βοήθειας και στήριξης στα παιδιά, τα λιγότερο τυχερά από άλλα, που βιώνουν καταστάσεις που ξεπερνούν όχι μόνο τις δικές τους δυνάμεις και δυνατότητες αλλά και τις δυνάμεις των ίδιων των γονιών τους και ολόκληρης της κοινωνικής ομάδας στην οποία ανήκουν.
Έτσι τα τελευταία χρόνια το «Ίδρυμα Μαριάννα Β. Βαρδινογιάννη» στάθηκε στο πλευρό των παιδιών που γεννήθηκαν με AIDS, των παιδιών των μητέρων που ζουν στις φυλακές, των παιδιών θυμάτων σεισμόπληκτων και πλημμυροπαθών περιοχών, των παιδιών θυμάτων των ναρκών ξηράς,